Ajouts ou corrections

ANTHEPROT

Logiciels d'analyse de séquences et de structures de protéines
Auteurs : G. Deléage et C. Geourjon
Laboratoire : Laboratoire de Bioinformatique et RMN structurales (PBIL - IBCP - CNRS UPR 412)
Plateformes : IBMrs6000, PC
Documentation : http://www.ibcp.fr/ANTHEPROT/Documentation_antheprot.html
Site ftp : ftp://ibcp.fr/pub/ANTHEPROT/

Ce serveur permet de prédire la structure du squelette d'une boucle de 3 à 8 résidus en fonction de sa séquence et de la structure de ses structures secondaires flanquantes. Le programmeattribue un facteur de fiabilité à chaque prédiction et expédie le(s)modèle(s) par e-mail.
Auteurs : J. Wojcik et J. Chomilier
Plate-forme : stations Unix
Laboratoire : Laboratoire Minéralogie-Cristallographie (CNRS UMRC7590)
Site : http://www.lmcp.jussieu.fr/~wojcik/modele/loop.html
Documentation : http://www.lmcp.jussieu.fr/~wojcik/modele/howto.html

Logiciel permettant la génération, l'optimisation et l'analyse de molécules et de systèmes moléculaires pouvant atteindre 100 000 atomes de 96 types différents. Automatisé pour la construction de peptides, d'acides nucléiques, de polymères et de cristaux organiques. Cristaux dont il permet la définition du facies en fonction du milieu de croissance.
Auteurs : G. Pepe et D. Siri
Laboratoire : Laboratoire de Chimie des Matériaux Moléculaire, Modélisation (ESA - CNRS 6 114)
Plateformes : Stations SGI
Documentation : http://chimir1.univ-mrs.fr/serveur
Site ftp : http://chimir1.univ-mrs.fr/serveur

Serveur Web de modélisation moléculaire de protéines
Auteurs : C. Combet, M. Jambon, G. Deleage et C. Geourjon
Laboratoire : Laboratoire de Bioinformatique et RMN structurales (PBIL - IBCP - CNRS UPR 412)
Plateformes : Stations Unix (SGI, SUN, IBM, ...), Mac (PowerPC)
Site : http://geno3d-pbil.ibcp.fr/

Auteurs : S. Pérez
Laboratoire : Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales
Banque de données sur les monosaccharides.
Paramètres développés pour les sucres sous le champ de force TRIPOS.

Environnement client-serveur Web intégrant la recherche de protéines similaires, l'édition et l'analyse d'alignement multiple, la recherche de sites et de motifs, la prédiction de structures secondaires des protéines.
Auteurs :  C. Blanchet, C. Combet, C. Geourjon et G. Deleage
Laboratoire : Laboratoire de Bioinformatique et RMN structurales (PBIL - IBCP - CNRS UPR 412)
Plateformes : Stations Unix (SGI, SUN, IBM, ...), Mac (PowerPC)
Documentation : http://.ibcp.fr/mpsa/
Site ftp : ftp://ftp.ibcp.fr/pub/mpsa/

Serveur Web d'analyse de séquence de protéines (BLAST, FASTA, SSEARCH, ClustalW, Multalin, Prédiction de structure secondaire, Pattinprot, etc).
Auteurs : C. Combet, C. Blanchet, C. Geourjon et G. Deleage
Laboratoire : Laboratoire de Bioinformatique et RMN structurales (PBIL - IBCP - CNRS UPR 412)
Plateformes : Stations Unix (SGI, SUN, IBM, ...), Mac (PowerPC)
Site : http://npsa-pbil.ibcp.fr/

Serveur Web de comparaison de structure 3D de protéines au niveau des sites "fonctionnels".
Auteurs : M. Jambon, G.  Deleage, et C. Geourjon
Laboratoire : Laboratoire de Bioinformatique et RMN structurales (PBIL - IBCP - CNRS UPR 412)
Plateformes : Stations Unix (SGI, SUN, IBM, ...), Mac (PowerPC)
Site : http://sumo-pbil.ibcp.fr/

Visualisation, gestion et intégration d'informations associées aux récepteurs couplés aux protéines G.
Auteurs : F. Campagne, B. Maigret et J.M. Bernassau
Laboratoire : Laboratoire de Chimie Théorique
Plateforme : SGI
Documentation et site ftp : http://brown.incm.u-nancy.fr/viseur/viseur.html

Analyse interactive des résultats de BLAST et FASTA.
Auteurs : P. Durand et J.P. Mornon
Laboratoire : Laboratoire de Minéralogie-Cristallographie (CNRS URA 09)
Plateforme : PC
Documentation et site ftp : http://www.lmcp.jussieu.fr/~durand