Eric Vangrevelinghe, Christophe Marot, Luc Morin-Allory.
I.C.O.A. Institut de Chimie Organique et Analytique, UPRES-A CNRS 6005, Université d'Orléans, BP6759, 45067 ORLEANS. Tél. 0238417042 - Fax. 0238417281.
http://www.univ-orleans.fr/SCIENCES/ICOA

 La démocratisation de l'ordinateur et les progrès effectués dans le domaine de l'électronique permettent d'obtenir maintenant à faible prix un ordinateur de type PC adapté à la réalisation de travaux de modélisation moléculaire. La puissance de calcul et la qualité graphique (OpenGL) sont proches des stations de travail professionnelles. Même si l'offre logicielle sur PC est encore restreinte, certains grands éditeurs commencent le portage de leurs programmes sur ce système. Ainsi, sous l'environnement 32 bits de Microsoft Windows, il existe déjà de nombreux programmes gratuits comme MOPAC, GAMESS, gOpenMol et d'autres commerciaux comme Spartan ou Alchemy 2000.

 Nous avons développé dans notre laboratoire une interface logicielle destinée à un environnement Windows avec un double objectif. Premièrement, il s'agissait de profiter de la puissance des PC de bureau actuels qui ne sont pas continuellement utilisés et ainsi décharger en partie les stations de calculs. Dans un deuxième temps, nous voulions apporter dans le cadre des cours d'initiation à la modélisation moléculaire un outil permettant de manière simple d'effectuer des calculs quantiques. Nous avons ainsi conçu BatchMan (Batch Manager). Celui-ci constitue une interface graphique avec principalement deux programmes de calculs quantiques (MOPAC V6 et GAMESS) et un programme de conversion de format de fichier (Babel) qui permet d'importer des fichiers d'entrée ou d'exporter les résultats. Outre cette interface graphique, ses principales caractéristiques sont:
- L'envoi des calculs à effectuer en Batch, c'est à dire en bloc, les calculs étant effectués les uns après les autres.
- La capacité d'utiliser plusieurs PC en réseau, les calculs à effectuer sont répartis entre les différents ordinateurs connectés et les résultats sont automatiquement centralisés.
- Une édition simple des fichiers d'entrée et la possibilité de changer les mots clefs sur tout une série de fichiers. Cette option est particulièrement intéressante lors du traitement d'un ensemble de fichiers obtenus à la suite d'une analyse conformationnelle.
- La visualisation le degré d'avancement des calculs et la sauvegarde des résultats sous la forme d'un tableau dans un fichier qui peut être au format HTML.
- L'interface possible vers un programme supplémentaire sous la condition qu'il s'exécute avec un nom de fichier comme argument de la ligne de commande.

 BatchMan est gratuit et fonctionne sous les systèmes Windows 9x et NT. Il se révèle très pratique aussi bien pour l'exécution de calculs quantiques ponctuels comme pour le traitement d'un grand nombre de fichiers sur plusieurs PC reliés en réseau. Il est accessible en ligne à partir de notre serveur Web (adresse ci-dessus).