La magnifique double hélice de Watson et Crick n'est qu'un aspect
de la structure de l'acide désoxyribonucléique. Pour remplir
ses rôles biologiques, l'ADN a besoin d'être flexible. Tantôt
replié au sein du noyau, tantôt déformé par
l'action des protéines de contrôle, tantôt localement
dénaturé pour permettre la transcription ou la translation
du message génétique, l'ADN est un polymère à
conformations multiples.
Aujourd'hui, la modélisation moléculaire est capable de fournir des informations sur la structure statique et dynamique de l'ADN en fonction de sa séquence de base, son environnement et ses interactions. Ces informations, complémentaires aux résultats expérimentaux, peuvent nous aider à comprendre les mécanismes qui sous-tendent le comportement complexe de ce polymère remarquable. Elles permettent aussi de rapprocher les regards différents portés sur l'ADN par des physiciens et des biologistes.
Références
1. JUMNA: Junction Minimisation of Nucleic Acids R. Lavery,
K. Zakrzewska, H. Sklenar Comp. Phys. Comm. 91 (1995) 135-158.
2. Molecular modelling of (A4T4NN)n
and (T4A4NN)n: Sequence elements responsible
for curvature. S. Sanghani, K. Zakrzewska, S.C. Harvey, R. Lavery. Nucleic
Acids Res. 24 (1996) 1632-1637.
3. DNA: An Extensible Molecule. P. Cluzel, A. Lebrun,
C. Heller, R. Lavery, J.-L. Viovy, D. Chatenay, F. Caron. Science
271 (1996) 792-794.
4. Modelling extreme stretching of DNA. A. Lebrun, R.
Lavery. Nucleic Acids Res. 24 (1996) 2260-2270.
5. Local DNA stretching mimics the distortion caused
by the TATA-box binding protein A. Lebrun, Z. Shakked, R. Lavery Proc.
Natl. Acad. Sci (USA) (1997) sous presse.
6. Conformational properties of the TATA-box binding
sequence of DNA. D. Flatters, M.A. Young, D.L. Beveridge, R. Lavery. J.
Biomol. Struct. Dyn. (1997) sous presse